1911年 熊本県阿蘇郡小国町宮原に、坂本謙吉、イカの3男として生まれる。
1929年 大津中学校（現・熊本県立大津高等学校）卒業。本郷絵画研究所に入り、
　　　 岡田三郎助に師事。
1931年 帝国美術学校（現・武蔵野美術大学）西洋画科入学。第1回独立展出品。
1933年 東京日日新聞社において第1回個展開催。
1934年 帝国美術学校は、3年次終了で中退。
1935年 兵役に。1945年まで3度応集。
1946年 長い兵役の後、熊本に帰郷し、阿蘇坊中で制作。風景、静物をモチーフにした
　　　 写実的な半具象の作品を描く。
1947年 第15回独立展、独立賞受賞。
1949年 独立美術協会会員となる。
1952年 熊本市に転居。
1957年 ヨーロッパへ。フランス・パリを拠点に、スペイン、イギリス、ドイツ、イタリアなど各地を訪れる。
1959年 帰国。熊本市にて制作。作品が日本の風土や生活にねざした抽象画へと変化をはじめる。
1965年 第33回独立展で児島賞受賞。
1967年 第35回独立展でG賞受賞。
1968年 九州産業大学教授に就任。
1973年 熊本県美術家連盟会長となり、以後5期10年務める。
1978年 熊本県近代文化功労者として表彰される。
1985年 熊本県立美術館で「坂本善三展」を開催。
1986年 FIEST展（パリ）で、リトグラフィ「構成80」が専門家賞（Prix Professionnel）を受賞。
1987年 熊本市で没。76歳。